六神丸具有清熱解毒、消腫止痛等功效，常用于咽喉腫痛、扁桃體炎、口舌糜爛、牙周炎及癰疽瘡癤、無名腫痛等病癥。但需注意的是，六神丸并不是所有人都可服用，下列六種情況則不宜使用：

    一、孕婦不宜：六神丸含麝香和雄黃等成分。麝香能引起子宮收縮，會引起流產或早產;孕婦亦忌雄黃，故孕婦禁用六神丸。

    二、嬰兒不宜：六神丸含有蟾酥，其有效成分為蟾毒素等，一次服過量即可引起中毒，故兩歲以下的嬰兒應慎用，新生兒禁用。

    三、不宜與地高辛合用：因心衰或房顫服地高辛的心臟病患者應忌服六神丸。因為二者合用可導致地高辛樣中毒，引起心律失常。

    四、不宜與消化酶合用：六神丸有抑制消化酶的作用，因此不宜與助消化藥多酶片、胃蛋白酶及淀粉酶合用，否則會使消化酶的療效降低或失效。

    五、不宜與阿托品合用：六神丸不宜與硫.酸鹽同服(硫.酸阿托品、硫.酸亞鐵等)，因為硫.酸鹽會促使雄黃中的硫化砷氧化，增加雄黃的毒性反應。

    六、不宜與華素片合用：華素片中含有碘分子，含碘的華素片與含朱砂的六神丸同服時，因朱砂中的二價汞能與碘結合，形成碘化汞類有毒汞鹽沉淀，而導致藥物性腸炎。

    此外，由于六神丸性香燥，易敗胃，故凡脾胃不足、身體虛弱者應慎用或禁用。對本品過敏者忌用。